Pengadilan Negeri Jakarta Utara yang mewilayahi 1 Kota dan 1 Kabupaten berpenduduk muslim sebanyak 1.463652 memiliki wilayah yurisdiksi Kota Administrasi Jakarta Utara dan Kabupaten Administrasi Kepulauan Seribu meliputi 8 Kecamatan dan 31 Kelurahan dengan rincian sebagai berikut :
- Kecamatan Cilincing terdiri 7 kelurahan : Kalibaru, Cilincing, Semper Barat, Semper Timur, Sukapura, Rorotan
- Kecamatan Koja terdiri dari 4 Kelurahan : Rawa Badak Selatan, Tugu Utara, Tugu Selatan dan Lagoa
- Kecamatan Kelapa Gading 3 Kelurahan : Kelapa Gading Barat, kelapa gading Timur dan Pegangsaan Dua
- Kecamatan Tanjung Priuk 4 Kelurahan : Papanggo, Warakas Sunter Agung, Sunter Jaya
- Kecamatan Pademangan 3 Kelurahan : Pademangan Barat, pademangan Timur dan Ancol
- Kecamatan Penjaringan 4 Kelurahan : Penjaringan, Pluit, Pejagalan dan Kapuk Muara
- Kecamatan Kepulauan Seribu Utara 3 Kelurahan : Pulau Pari, Pulau Tidung, Pulau Untung Jawa
- Kecamatan kepulauan Seribu Selatan 3 Kelurahan : Pulau Harapan, Pulau Panggang dan Pulau Kelapa